技术
由于填料材质理化性能的优越性和生物膜(Biofilm)工艺的自身优势，这类反应器应用到ANAMMOX领域后，很快便得到人们的关注。
Schematic diagram of Biofix reactor
Sen Qiao, et al. J BIOSCI BIOENG, 2009
Schematic drawing of an ANAMMOX upflow biofilm reactor
Chongjian Tang, et al. SEP PURIF TECHNOL,2009
2008 年初，荷兰 Delft 大学的一组研究人员利用内置式 MBR 实现了 ANAMMOX 菌“Candidatus Kuenenia stuttgartiensis”达97.6%的富集培养，而且世代时间也缩短至 8.3 天。
van der Star, et al. BIOTECHNOL BIOENG, 2008
影响因素
接种污泥的影响
由于ANAMMOX菌的生长极为缓慢，以硝化(亚硝化)反应器污泥，反硝化污泥，污水厂活性污泥等污泥作为接种底泥启动ANAMMOX过程比较困难，具体体现在富集效率低：世界首座ANAMMOX实际工程反应器以反硝化污泥作为接种底泥，从启动到初步实现厌氧氨氧化共耗费三年半的时间。
随着ANAMMOX反应器在实际工程的广泛应用，一些学者开始部分或全部采用其他已成功启动并运行中的ANAMMOX反应器的排泥来启动新建的ANAMMOX反应器(实验室规模或实际工程规模)，这一措施无疑大大缩短了ANAMMOX反应器的启动时间，从原来的几年减少到1年以内，据报道最短的启动时间仅为2个月。
